Phòng khám thu tiền khám, tiền thuốc mỗi ngày, nhưng nhiều nơi vẫn lúng túng khi bệnh nhân hỏi xin hóa đơn đỏ: dịch vụ khám có chịu thuế GTGT không, thuốc thì sao, hộ kinh doanh có phải xuất hóa đơn điện tử không. Bài viết tổng hợp các quy định đang áp dụng năm 2026 và cách xuất hóa đơn ngay từ phiếu thu.
- Hóa đơn điện tử thực hiện theo Nghị định 123/2020/NĐ-CP, sửa đổi bởi Nghị định 70/2025/NĐ-CP (hiệu lực 01/06/2025).
- Theo Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15, dịch vụ khám chữa bệnh, xét nghiệm, chiếu chụp không chịu thuế GTGT. Thuốc bán riêng chịu thuế suất 5%.
- Từ 01/01/2026 bỏ thuế khoán. Hộ kinh doanh có doanh thu trên 1 tỷ đồng/năm phải dùng hóa đơn điện tử.
- Phòng khám là doanh nghiệp: bắt buộc dùng hóa đơn điện tử.
Phòng khám nào phải dùng hóa đơn điện tử?
| Loại hình | Quy định |
|---|---|
| Công ty, doanh nghiệp | Bắt buộc dùng hóa đơn điện tử theo Nghị định 123/2020 và Nghị định 70/2025. |
| Hộ kinh doanh | Thuế khoán bị bỏ từ 01/01/2026. Theo Nghị định 68/2026/NĐ-CP và Nghị định 141/2026/NĐ-CP sửa đổi, hộ có doanh thu năm trên 1 tỷ đồng phải dùng hóa đơn điện tử có mã hoặc hóa đơn khởi tạo từ máy tính tiền. Hộ phải đăng ký trong 30 ngày kể từ cuối kỳ tính thuế có doanh thu lũy kế vượt ngưỡng. |
Nghị định 70/2025 cũng cho phép hộ kinh doanh ủy nhiệm bên thứ ba lập hóa đơn. Cơ sở có khám chữa bệnh BHYT lập hóa đơn cho cơ quan BHXH tại thời điểm được thanh, quyết toán chi phí.
Ghi thuế GTGT trên hóa đơn phòng khám thế nào?
- Tiền khám, xét nghiệm, siêu âm, chụp chiếu: không chịu thuế GTGT (khoản 10 Điều 5 Luật Thuế GTGT 2024). Thuốc dùng trong gói điều trị cũng không chịu thuế.
- Thuốc bán riêng theo đơn: thuế suất 5%.
- Dịch vụ thẩm mỹ không nhằm mục đích chữa bệnh: phòng khám nên hỏi ý kiến kế toán hoặc cơ quan thuế về thuế suất áp dụng.
Vì một lần thu tiền thường gồm cả dịch vụ không chịu thuế và thuốc chịu thuế, phần mềm cần tách đúng từng dòng trên hóa đơn. Cách lập hóa đơn cụ thể (hóa đơn GTGT hay hóa đơn bán hàng) phụ thuộc phương pháp tính thuế của phòng khám; nên để kế toán xác nhận.
Những lỗi hay gặp
- Xuất hóa đơn sau nhiều ngày, sai thời điểm lập hóa đơn.
- Nhập tay lại tên dịch vụ, số tiền từ phiếu thu sang cổng hóa đơn, dễ lệch số.
- Ghi sai mã số thuế hoặc tên đơn vị khi khách là công ty (khám sức khỏe cho nhân viên).
- Hủy phiếu thu nhưng quên hủy hoặc điều chỉnh hóa đơn tương ứng.
Xuất hóa đơn điện tử ngay từ ezMed
- Kết nối sẵn 3 nhà cung cấp: MISA meInvoice, EasyInvoice và XInvoice. Phòng khám dùng tài khoản hóa đơn của chính mình.
- Phát hành từ phiếu xuất (phiếu thu tiền): thông tin dịch vụ, thuốc, số tiền lấy từ phiếu, không nhập lại. Làm được trên cả web và app mobile.
- Tra cứu người mua theo mã số thuế để điền tên, địa chỉ công ty.
- Hủy hóa đơn ngay trong phần mềm khi cần.
Hiện ezMed chưa hỗ trợ hóa đơn khởi tạo từ máy tính tiền và chưa kết nối VNPT, Bkav. Hướng dẫn chi tiết: Phát hành hóa đơn điện tử (MISA, EasyInvoice, XInvoice).
Thử thu tiền bằng VietQR và xuất hóa đơn trên dữ liệu của phòng khám: đăng ký dùng thử ezMed miễn phí 14 ngày.
Bài viết mang tính tham khảo, cập nhật đến tháng 10/2026, không thay thế tư vấn thuế. Phòng khám nên xác nhận với kế toán hoặc cơ quan thuế quản lý.